Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spta1P08032 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spta1P08032 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spta1P08032 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spta1P08032 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spta1P08032 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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