Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01757 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01757 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01757 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01757 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01757 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01757 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01757 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01757 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01757 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01757 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01757 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01757 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01757 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01757 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01757 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01757 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms