Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01748 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01748 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01748 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01748 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01748 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01748 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01748 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01748 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01748 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01748 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01748 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01748 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01748 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01748 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01748 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01748 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms