Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnb1P01575 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifnb1P01575 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnb1P01575 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms