Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnkO88874 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnkO88874 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnkO88874 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnkO88874 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnkO88874 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnkO88874 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnkO88874 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnkO88874 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnkO88874 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnkO88874 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnkO88874 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms