Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly86O88188 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly86O88188 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly86O88188 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly86O88188 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms