Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChkbO55229 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChkbO55229 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkbO55229 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkbO55229 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkbO55229 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkbO55229 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms