Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FiglaO55208 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FiglaO55208 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FiglaO55208 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FiglaO55208 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FiglaO55208 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FiglaO55208 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms