Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp10O55123 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp10O55123 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp10O55123 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp10O55123 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp10O55123 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp10O55123 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp10O55123 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp10O55123 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms