Protein–RNA interactions for Protein: O55091

Impact, Protein IMPACT, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ImpactO55091 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ImpactO55091 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ImpactO55091 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ImpactO55091 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ImpactO55091 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ImpactO55091 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ImpactO55091 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ImpactO55091 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms