Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabep1O35551 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rabep1O35551 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabep1O35551 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.1 ms