Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Abcc1O35379 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc1O35379 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc1O35379 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms