Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf5O35326 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms