Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebi3O35228 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebi3O35228 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ebi3O35228 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ebi3O35228 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ebi3O35228 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ebi3O35228 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ebi3O35228 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ebi3O35228 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms