Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casq1O09165 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq1O09165 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq1O09165 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casq1O09165 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casq1O09165 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
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