Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NumblO08919 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NumblO08919 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NumblO08919 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NumblO08919 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NumblO08919 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NumblO08919 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NumblO08919 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NumblO08919 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NumblO08919 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NumblO08919 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NumblO08919 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NumblO08919 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NumblO08919 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NumblO08919 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NumblO08919 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NumblO08919 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NumblO08919 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NumblO08919 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NumblO08919 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NumblO08919 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NumblO08919 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NumblO08919 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NumblO08919 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NumblO08919 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NumblO08919 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NumblO08919 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NumblO08919 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NumblO08919 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NumblO08919 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms