Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r78K7N6U5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r78K7N6U5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r78K7N6U5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r78K7N6U5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r78K7N6U5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r78K7N6U5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r78K7N6U5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r78K7N6U5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r78K7N6U5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms