Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm2056J3QQ02 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms