Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccer2J3QPU5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccer2J3QPU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccer2J3QPU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccer2J3QPU5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms