Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5849J3QPE5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5849J3QPE5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms