Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms