Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim18J3QNP2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim18J3QNP2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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