Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3336J3QMQ6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3336J3QMQ6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3336J3QMQ6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3336J3QMQ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3336J3QMQ6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3336J3QMQ6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms