Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20834J3QM72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20834J3QM72 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms