Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21060J3KMU4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21060J3KMU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms