Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp408H7BX78 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp408H7BX78 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms