Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sclt1G5E861 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sclt1G5E861 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms