Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b1G5E829 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms