Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933406M09RikG3XA12 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933406M09RikG3XA12 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933406M09RikG3XA12 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms