Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zc3h12bG3X9I7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zc3h12bG3X9I7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms