Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-1G3UXB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-1G3UXB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms