Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccl26F8VQM2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl26F8VQM2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms