Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LctF8VPT3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LctF8VPT3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms