Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5160F8VPN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5160F8VPN3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms