Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm28038F7BCN9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm28038F7BCN9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28038F7BCN9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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