Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8247F6VRJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8247F6VRJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms