Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rdh16f1E9Q9P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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