Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
BC005561E9Q5E2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BC005561E9Q5E2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BC005561E9Q5E2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms