Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930579F01RikE9Q3L6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms