Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc4E9Q236 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc4E9Q236 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms