Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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