Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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