Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Zfp558E9Q1J0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Zfp558E9Q1J0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Zfp558E9Q1J0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Zfp558E9Q1J0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Zfp558E9Q1J0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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