Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms