Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rsf1E9PWW9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rsf1E9PWW9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rsf1E9PWW9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rsf1E9PWW9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rsf1E9PWW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rsf1E9PWW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rsf1E9PWW9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rsf1E9PWW9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rsf1E9PWW9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms