Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim30dE9PWL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms