Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1110002E22RikE0CYV9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms