Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930558K02RikE0CXC6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930558K02RikE0CXC6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms