Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc6D3YZP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc6D3YZP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
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