Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rexo5D3YW29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo5D3YW29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms